Оба варианта возможны.
Возможны оба варианта, предпочтительный: Вдали виднелся темный лес и озеро.
Здесь больше подходит вопрос "каким?".
В тексте возможно согласование в среднем роде (по грамматическому роду слова "озеро").
Правильно: озеро Горных Духов (если таково действительное, «официальное» наименование озера, а не его образное название).
Правильно: на озере Байкал. Названия озер не склоняются в сочетании с родовым словом озеро. Исключение составляют случаи, когда топоним выражен прилагательным: на Онежском озере.
В Вашем примере слово употреблено как существительное.
ЦЕЛОЕ, -ого; ср.
1. Матем.
Число без дроби. Отнять дробь от целого.
2.
Нечто единое, нераздельное. Парк и архитектурный ансамбль составляют одно ц. Стройное, единое ц. Изъятие этого эпизода из пьесы нарушит ц. Пожертвовать частностями во имя целого.
Правильно: национальный парк «Озеро Накуру».
Правильно: Белое движение (в годы Гражданской войны в России и в последующие годы).
Корректно: из озера Байкал.