Крректно слитное написание: Готовая рукопись так и осталась неопубликованной, затерявшись на чердаке дома. Неопубликованной – это отглагольное прилагательное.
Следует писать раздельно.
Правильно раздельное написание: к причастию с не относится зависимое слово ранее.
Да, верно: ранее выполненные работы.
Внутри этого придаточного предложения запятые не нужны, но само придаточное выделяется (или отделяется) запятыми: ..., одним из которых является подготовка к изданию неопубликованных глав, ...
Причастие с не пишется раздельно, если есть зависимые слова: ранее не изданные произведения, ранее не издававшиеся произведения, неизданные рукописи.