Обособление факультативно.
Обособление факультативно.
Да, слова кроме того обособляются.
Обороты с помимо обособляются как вводные. Сочетание в связи с этим, как правило, не обособляется.
Запятая нужна. Подробнее см. в "Справочнике по пунктуации".
Да, это вводное сочетание.
Запятые нужны: Учтите, что, помимо спорткомплекса, у меня есть еще академия. Подробнее см. в "Справочнике по пунктуации".
Запятая предпочтительна (но не строго обязательна). О пунктуации при слове помимо см. в «Справочнике по пунктуации».
Это тот случай, когда деепричастный оборот, стоящий после союза а, невозможно «оторвать» от союза, изъять из предложения или переставить в другое место без разрушения структуры предложения. Подобные случаи представлены в параграфе 20.2 справочника по пунктуации Д. Э. Розенталя, например: Он начал приносить книги и старался читать их незаметно, а прочитав, куда-то прятал (М.Г.).
В Вашем примере «напрашивается» тире, поскольку наблюдается восстанавливаемая из контекста неполнота как в деепричастном обороте (пропущено слово мышцы), так и в основной части предложения (пропущено подлежащее червь или он), а кроме того, есть параллелизм частей. Однако и деепричастный оборот нужно закрыть, а другого знака, помимо запятой, для этого не предусмотрено. Из этого делаем вывод, что запятая перед тире ставится: Сокращая кольцевые мышцы, червь проникает между частицами почвы, а сокращая продольные, — раздвигает их в стороны.