Корректно: сырье для мясо-и рыбоперерабатывающей промышленности.
Предпочтительно не переносить это слово.
Запятые не нужны.
Верно: Главное сырье в пекарне, конечно же, мука.
Оба варианта возможны.
Да, в словосочетании "сырье российского производства" слово "российского" пишется со строчной буквы.
Запятую надо поставить.
В таком случае мы не сможем расплатиться за сырье и энергоносители, и не сможем обеспечить Вам необходимый запас, и вынуждены будем остановить печь.