Литера пишется слитно с последней цифрой номера: улица Калинина, 41б. Предпочтительна строчная буква, прописная допускается, если строчную букву можно спутать с цифрой.
Географические названия на -ов (-ев), -ово (-ево), -ин, -ино (-ыно) имеют в творительном падеже окончание -ом, например: Харьков – Харьковом, Калинин – Калинином, Львов – Львовом, Канев – Каневом, Крюково – Крюковом, Камышин – Камышином, Марьино – Марьином, Голицыно – Голицыном. В отличие от названий городов русские фамилии на -ин (-ын) и на -ов (-ев) имеют в творительном падеже единственного числа окончание -ым, ср.: Михаилом Калининым – под городом Калинином.
Запятая нужна. Ученая степень и звание являются однородными приложениями.
Дополнительные знаки препинания в этой фразе не нужны.
Запятая нужна, она ставится в соответствии с правилами правописания.