Обстоятельство в случае наличия необходимых сведений конкретизирует, уточняет обстоятельство в дальнейшем и нуждается в обсоблении: В дальнейшем, в случае наличия необходимых сведений, будет осуществлена подготовка проекта.
Сочетание в дальнейшем играет роль обстоятельства времени (отвечает на вопрос когда?) и не требует обособления.
Запятая нужна.
Запятая после в дальнейшем не нужна.
Предложенный Вами вариант пунктуационного оформления предложения возможен.
Запятые в этом предложении не нужны. Нет оснований для их постановки.