Верно: боится темноты.
Здесь верно: начальник с подчиненными ушли вовремя. Ср.: начальник ушел с подчиненными.
Так написать можно.
Второй вариант предпочтителен.
Лучше: последний автобус по расписанию.
Правильно: на автобазу.
Указанные запятые не нужны.
Корректно: совершенно непригодны.
Не нужно ставить запятую после даты.
Да, все элементы адреса разделяются запятыми.