См. в «Письмовнике».
Запятая не требуется.
Корректно: Мы называем их именно этим именем, несмотря на то что они...
В обоих случаях нужно поставить запятую перед обращением.
Инициалы имени и отчества обычно располагают перед фамилией. Исключение составляют алфавитные пофамильные списки и некоторые другие случаи.
Вы написали верно: мужская фамилия Ким изменяется как существительное второго склонения: Кима, Киму, Кима, Кимом, о Киме. Женская фамилия Ким не склоняется.