Правильно: города Мирного. Подробнее см. в «Письмовнике».
Да, правильно: в городе Мирном, в микрорайоне Заречном.
Корректно: является квинтэссенцией, представляет собой квинтэссенцию.
Зональный соотносится с существительным зона в значениях: 1) географический пояс и 2) территория, область, а зонный – с тем же существительным в значениях: 1) территория, область и 2) место отбывания наказания.