Правильно: не то один, не то два раза.
Эта фамилия должна склоняться. Вероятно, фамилию не просклоняли из-за того, что ударение падает на последний слог. Но это ошибка: из фамилий, оканчивающихся на -а, -я ударное, не склоняются только французские (Дюма, Золя).
Верно: сотрудник базы-филиала (находится на рабочем месте).
Кавычки не нужны.