Перед писать лучше поставить тире.
Ставится запятая перед союзом. Предложение сложноподчиненное.
Запятая не нужна ни перед и, ни перед да: Утреннюю тишину нарушали лишь всплески воды, скрип уключин да крики чаек и бакланов.
Вы написали верно: изолятор "Матросская Тишина".