Эти слова различаются по значению: топ-сайты – это сайты, лучшие по какому-то признаку (занимающие первые строчки в рейтинге), а топ сайтов – сам рейтинг, список лучших сайтов.
Оба варианта корректны, при этом предпочтение отдается варианту рельсов.
Кавычки не нужны.
Запятая перед как нужна: она разделяет части сложноподчиненного предложения.
При проверке написания слов важно пользоваться словарями современного русского языка. Словарь Ушакова составлен в 1935–40, словарь Брокгауза и Ефрона – дореволюционное издание. Со времени выхода в свет этих словарей многие слова изменили свое написание. Сегодня правильно только чёботы.
Это предложение с прямой речью, верен первый вариант.