В орфографическом словаре рекомендовано написание: Совет безопасности, однако в «Кратком справочнике по оформлению актов Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации» зафиксирован первый вариант (все слова с прописной).

Верно с двумя Н.

Правильно: совет директоров.

Заглавная и прописная буква – это одно и то же. Это большая буква. Маленькая буква – строчная.

Сочетания ученый совет, ученый секретарь пишутся строчными.

Сочетание ученый совет пишется строчными. А что такое большой ученый совет?

Следует писать раздельно.

Постановка тире не требуется.

Если совет – первое слово официального названия, оно пишется с прописной: Совет при Президенте РФ по содействию развитию институтов гражданского общества и правам человека. Если совет –  не первое слово в официальном названии, оно пишется со строчной: Геральдический совет при Президенте РФ.