Верен второй вариант.
Ответ см. в «Письмовнике».
См. ответ 270919.
Если речь идет о музыкальном термине (интервал между звуками), правильно: полутоны. В знач. 'переход от светлых тонов к темным; отсутствие резких контрастов, плавность перехода' правильно: полутона.
Вы написали правильно.