Можно оплатить счет, заплатить по счету.
Запятая не нужна.
Верно: в течение трех дней.
Все три варианта корректны. Выбор может зависеть от ситуации и контекста.
Ошибка здесь: оплатить за. Так нельзя говорить и писать. Правильно: оплатить что-либо, заплатить за что-либо.
Запятую нужно поставить. В пунктуации это предложение будет рассматриваться как сложносочиненное с двумя безличными частями. В таких предложениях запятая не ставится, если форма сказуемых одинакова (ср.: С деревьев капало и вокруг пахло листвой; Необходимо рассмотреть авторские заявки и надо срочно составить по ним заключения). В Вашем предложении форма сказуемых разная.
Указанная запятая ставится.
Правильно: уплатить, заплатить штраф.
Корректно. Оплатить стоимость = отдать деньги в возмещение величины затрат на что-либо.