Слово очень подчеркивает утверждение, поэтому правильно слитное написание: очень непрост.
Запятая нужна: необходимо закрыть придаточное предложение.
Следует писать слитно. Верен второй вариант.
Оба варианта возможны.
Запятая не нужна, если слово "пусть" относится к обеим частям сложного предложения.