Оба варианта верны. Согласно «Грамматическому словарю русского языка» А. А. Зализняка, Токио может употребляться и как существительное мужского рода, и как существительное среднего рода.
Что Вы имеете в виду? Случаи типа сиденИе - сиденЬе?
Нет, такая замена правилами не предусмотрена.
Не нужен: Сфотографируй — пригодится.
Да, это имя будет склоняться (Мории, Мории, Морию, Морией, о Мории).
Ваш вариант написания корректен.