Лучше написать: ученики 1-го и 2-го класса. Если первых и вторых классов несколько, то лучше писать словами: ученики первых и вторых классов.
Пожалуйста, поясните, какие обозначения Вы называете "новыми", а какие - "старые".
Да, в этом случае буквенные наращения нужны.
Корректно: ...набор учащихся в 9-е классы или набор учащихся, окончивших 9-й класс.