См. в Горячей десятке вопросов.
Возможны обе формы сказуемого.
Название при словах городской округ обычно не склоняется. Верно: в г. о. Самара.
Оба варианта управления корректны.
В конструкциях с составными числительными, оканчивающимися на два, три, четыре, винительный падеж сохраняет форму именительного независимо от категории одушевленности. Литературная норма: трудоустроили семьдесят три беженца. Вариант трудоустроили семьдесят трех беженцев – разговорный.
Правильно: зарплаты работников (о зарплате каждого работника) и зарплата работников (в целом).
Правильно: в городе Самаре.