Корректно: греческие "Темные века".
Нет, такая формулировка некорректна: четверть века не может относиться к слову день.
Верно: В конце XVIII – начале XIX века.
Правильно: конец XVIII — начало XIX века.
Не вызовет сомнения у слушающего вариант в пятнадцатом и шестнадцатом веках.