Ударение падает на последний слог в обоих словах: Покрова на Нерли.
Вы написали верно: орден Русской православной церкви.
Слово Берлин лучше написать в скобках: Анна Фогель (Берлин) разработала методику...
В таких конструкциях, как правило, пишут во множественном числе: белки, жиры, углеводы. В единственном числе – если есть слово содержание: содержание в 100 г продукта: белка – ... жира – ...
Да, нужно склонять.
Строгая литературная норма: брелоков; вариант брелков, запрещавшийся ранее, сейчас признается допустимым.
Слово пачули склоняется, нероли не склоняется. Таким образом, верно: аромат пачулей, аромат нероли.
В сочетании казус белли оба слова не склоняются.
Это предложения, но не словосочетания.
Верно: нет ни одной церкви, где бы не было его иконы.