Деепричастный оборот, в начале которого стоят частицы только, лишь, интонационно не отделяется от предшествующей части предложения (при чтении пауза перед ним не делается), но запятая перед ним обычно ставится: Скоординировать свои действия преступники могли, только находясь в СИЗО.

Правильно: им руководит.

Можно использовать кавычки, читателю в этом случае будет легче воспринимать текст.

В словарях "художественное" слово изо - только как первая часть сложных слов: изостудия, изокружок. В значении "изобразительное искусство" самостоятельное слово изо имеет разговорно-просторечную окраску.

Устойчивое выражение: Шила в мешке не утаишь.

Самый быстрый способ узнать - посмотреть в электронных словарях.

В словарях зафиксированы варианты: изо всей силы и изо всех сил «применяя всю свою силу, энергию».

Правильно: изделие изо льна.

Действительно, первый вариант допускает двоякое толкование. Фразу следует перестроить, руководствуясь логикой.

Предложенный Вами вариант корректен.