Да, это название склоняется: церковь в Кижах.
Правильно: трёхмачтовове судно.
Нужно поставить знак препинания в конце предложения, иные знаки не требуются.
Можно не ставить запятую.
Правильно: как бы чужие не пришли.
Чили может употребляться как существительное женского рода и как существительное среднего рода.
Указанная запятая нужна.
Это и правда очень сложно – доказать носителям языка, уверенным, что их фамилия не склоняется, что они неправы. Возможно, Вам поможет статья нашей рубрики «8familii/">Азбучные истины».