Верно: микробно-биологический. А откуда рекомендация о "первично-активном"?
Большой толковый словарь
Система постоянных наблюдений, оценки и прогноза изменений состояния какого-л. природного, социального и т.п. объекта. Биологический, экологический, культурный м. Система мониторинга. < Мониторинговый, -ая, -ое. М-ые данные.
В данном случае производитель, он же автор названия - единственный источник нормативного произношения.
Пунктуация в предложении корректна.