Верно: ...в размере девяноста одного миллиона рублей РФ.
Правильно: в размере 10543 рублей.
Оба варианта возможны. Разобраться в чем-либо - стилистически нейтральный вариант. Разобраться с чем-либо - употребительнее в разговорной речи.
Правильно: в пятистах метрах, в размере восьмисот рублей.
Верно: в размере 5,0 должностного оклада.
Если существительные и прилагательные в сочетании с не обозначают непринадлежность к какому-либо разряду лиц или явлений, то они пишутся слитно. Ср.: Неврач не разберется в этом; Неспециалистам доклад понравился; Неегиптолог его не поймёт.