Форма именительного падежа множественного числа - протоколы.
Правильно только типовой во всех значениях.
Верно: согласно протоколу, согласно письму.
Глагол запечатлеть использован некорректно. Предложение следует перестроить.
Варианты равноправны.
1. В значении "ради исполнения": во исполнение.
2. Корректно: срок предоставления.
В большинстве текстов (кроме международных актов) используется строчная буква.
Стоянка поезда – одна минута. Согласно протоколу, решению, расписанию.