Запятая ставится при втором смысловом варианте.
Пунктуационно корректно: Для того чтобы у пользователя появился доступ к АРМ ССД, необходимо, чтобы... Обратите внимание на повтор слова чтобы. Лучше таких повторов избегать.
Словари отмечают оба варианта в им. п.: опера-буффа и опера-буфф. В обоих случаях второй компонент слова несклоняемый.
Очевидно, здесь хорошо если означает 'в лучшем случае' и явно стремится к функции частицы. Сравним частицы, образованные на базе слова хорошо: хорошо ещё, хорошо хоть. В практике письма встречается разное пунктуационное оформление сочетания хорошо если в подобных контекстах, о чём пишет М. М. Харченко в статье о нерешенных вопросах современной пунктуации. В справочниках и специальных словарях сочетание не приводится.
Управление между чего-либо устаревает. Предпочтительно: между скалами.
Запятая нужна, если сочетание на лету поясняет сочетание так же: так же, то есть на лету.
Знаки препинания в предложении расставлены верно.