Корректно: Информация о дипломатической миссии в Японии.
1. Правильно: хоругви. Хоругвь – род знамени на коротком поперечном древке, привешенном к длинному вертикальному древку, с двумя языками и с изображением Христа, Богородицы.
2. О газырях см. в «Непростых словах».
3. Фасция – пучок прутьев с топориком в середине, перевязанный ремнем, как показатель власти высших должностных лиц в Древнем Риме.
Мужская фамилия Москот склоняется. Верно: священномученика Паисия (Москота)...
Ошибка - в некорректном противопоставлении.
Верно, о пунктуации с предлогом помимо подробнее см. «Справочник по пунктуации».