Верно без кавычек: на отлично.
Во второй части предложения (после но) подлежащее и сказуемое выражены существительными. Однако тире между ними не ставится, поскольку перед сказуемым есть частица вовсе и отрицание. Таким образом, верная пунктуация: Они действительно обладают отличной выносливостью, но причина этого вовсе не врожденная способность.
Варианты имеют разные оттенки значения.
Правильно: У меня, как всегда, все отлично.
Запятая нужна.
Эти слова заключать в кавычки не нужно.
Запятая не нужна. Оборот с как не обособляется, если входит в состав сказуемого или тесно связан с ним по смыслу.
Да, здесь уместны кавычки.