В данном случае слово вязанный (причастие с зависимым словом) нужно писать с двумя буквами Н.
Корректная пунктуация: Руссо утверждал, что только мужчина, обладающий разумом и не связанный, в отличие от женщины, с природой, является гражданином.
Запятая, закрывающая пояснительный оборот или эпоха Водолея, нужна.
Такой способ морфемного разбора слова тоже возможен. Наш ответ дан по "Морфемно-орфографическому словарю" А. Н. Тихонова.