Да, верно: стакан со ста миллилитрами воды.
Верно: полутора стаканов, полутора стаканам, полтора стакана, полутора стаканами, о полутора стаканах.
Обе формы родительного падежа имеют право на существование в подобных конструкциях.
Такое сочетание не ошибочно, оно встречается в художественной литературе. Например: А хуже всего было то, что, когда он произнёс эту свою шутку богатого гуляки, я заметил, что она улыбнулась в уже пригубленный стакан, и улыбнулась довольно язвительно. Ф. Искандер, Письмо. Даже стакан, пригубленный Вальганом, хотелось выбросить. Г. Николаева, Битва в пути.
Правильно: шаровой кран.