Правильно: в количестве 31 коробки и 15 папок.
Верно: Щенок сгрыз мою тапку.
Правильно: тапка, тапочка. Это слова женского рода.
Дополнительные знаки препинания не нужны.
Выбрать нужное слово затрудняемся. Просим Вас обратиться к посетителям нашего грамотного форума.
Следует использовать форму единственного числа (ждет).