Знаки препинания расставлены верно. Между инициалами нужен пробел.
Согласно орфографическим словарям написано правильно. Однако в официальных документах по традиции слово министр в названии должности пишут с большой буквы.
См. ответ на вопрос № 275447.
Верно: в подчинении кому. Но лучше: подразделение подчинено заместителю директора.
Фонетический принцип действует и здесь: пишем, как слышим.
Лучше: Ввести в состав комиссии Иванова Ивана Ивановича, заместителя начальника отдела, – членом комиссии.