Да, правильно: 3-мерный.
Раздельное написание не заметный правильно в следующих случаях: если есть или подразумевается противопоставление; если при прилагательном в качестве пояснительного слова стоит местоимение, начинающееся с ни (ни для кого не заметный), если не входит в состав усилительных отрицаний далеко не, отнюдь не, вовсе не, ничуть не, нисколько не и т.п., предшествующих прилагательному (нисколько не заметный). В остальных случаях правильно слитное написание.
Степени сравнения имеет только прилагательное плохой: хуже, наихудший.
Запятая не требуется.
Запятая нужна, она должна закрыть уточняющий оборот.