Возможны варианты: уничтожать микробы и микробов. Но в данном контексте предпочтительно (в целях снятия падежной омонимии миробы им. п. - микробы в. п.): растения уничтожают микробов.
Пунктуация верна.
Ошибки нет.
Запятые нужны.
Предложение (Этимология... знает) построено некорректно.
Разница в написании связана с разницей в произношении этих прилагательных: под ударением в этих словах мы пишем то, что слышим.
Запятая нужна, таким образом выделяется пояснительный член предложения задолго до атомной войны между двумя видами.
Ваш вариант расстановки знаков верный.
Такое утверждение неверно. Если заболевание вызвано грибком (споровыми микроорганизмами), то оно называется грибковым.