Корректно: радио "Эхо Москвы — Самара".
См. в Горячей десятке вопросов.
Это интонационно-логическое тире.
Предпочтителен первый вариант.
Кавычки уместны.
Такие фамилии нужно склонять.
Фамилия на гласную а, стоящую после согласной, должна склоняться. Исключение составляют французские фамилии с ударением на последнем слоге. Правило можно прочитать в «Письмовнике» (пункт 13.1.11).
Правильно: в городе Самаре.