Правильно: заведующему отделом.
Правильно строчными, без кавычек: отдел биофизики макромолекул.
Названия отделов организаций пишутся строчными буквами.
Второй вариант аббревиатуры предпочтителен. Рекомендуем за уточнениями обращаться к справочным материалам, размещенным на нашем портале.
Правильно: положение о юридическом отделе. Предлог об употребляется только перед гласными, а слово юридическом начинается с согласного звука [j].
Верен второй вариант.
Беспредложный вариант удачнее.
См. «Словарь трудностей».
Первый вариант.