Верно: 5,5 тонны; пять с половиной тонн.
Верно: аффилированный. См. словарную статью из «Большого толкового словаря русского языка» под ред. С. А. Кузнецова.
Слово точно не является вводным и не требует выделения запятыми.
Слово груды входит в состав сказуемого.
Точно неизвестно = наверняка неизвестно. Точно не известно = известно не точно.