Запятая нужна.
Это сочетание пишется строчными буквами.
В «Большом академическом словаре русского языка» (гл. ред. К. С. Горбачевич. Т. 7. М., СПб., 2007) слово казачий приравнено по значению к слову казацкий.
Оба варианта возможны.
Правильные варианты:
Мальчик с пальчик, Мальчика с пальчик и Мальчик-с-пальчик, Мальчика-с-пальчика (сказочный персонаж)
мальчик с пальчик, мальчика с пальчик и мальчик-с-пальчик, мальчика-с-пальчика (о ребенке)