Запятая не нужна.

Меридианный - "относящийся к меридиану". Меридиональный - "направленный с севера на юг, по меридиану". 

А что это за конгресс? В каком значении здесь употребляется прилагательное?

Дело в том, что слово меридиональный не было образовано в русском языке от меридиан. Это прилагательное, как и существительное меридиан, было заимствовано, оно восходит к немецкому meridional или французскому méridionale от латинского meridionalis. Таким образом, разные основы с разными гласными (meridianus и meridionalis) были уже в латинском языке.

Корректно написание через тире: в эоцене -- голоцене, с эоценом -- голоценом.

Уместно слитное написание, если нет противопоставления (реального или подразумеваемого).

Правильно: меридиональный. Правописание слов проверяется по орфографическому словарю (можно воспользоваться нашим электронным словарем, набрав мериди*ный).