Запятая не нужна. Обратите внимание: частицу не нужно поставить перед глаголом было, сочетание эпидемиологическая обстановка нуждается в определении, например: Внеклассное мероприятие не было проведено в связи с неблагоприятной эпидемиологической обстановкой.