Согласовывает — это форма настоящего времени глагола несовершенного вида согласовывать. Согласует — форма будущего времени глагола совершенного вида согласовать.
Если смысл "согласовывает без замечаний", то запятая нужна. Если "указанные без замечаний" - не нужна.
Указанные запятые нужны, если обороты с как имеют дополнительное значение причины. Если такого значения нет, запятые не требуются.
Запятая не нужна. Правильно: согласовывает с Вами.
Написано - сказано, указано. Не вполне понятно, в каком значении употреблено слово согласовывает (с кем согласовывает?).
Оба варианта правильны.