Правильно: действующего.
Верно: ...в лице генерального директора Ивановой А. Р., действующего на основании Устава.
Правильно: действующего. В письменной деловой речи принята норма согласования с названием должности – директор (безотносительно к полу).
Правильно: ...в лице генерального директора Маши Ивановой, действующего на основании Устава.
Работодатель в лице председателя правления Ивановой Марии Ивановны, действующего на основании Устава....