Верен второй вариант.
В большинстве случаев слово одна избыточно. Например, правильно: тысяча девятьсот девяносто девятый год; На Вашем счете тысяча рублей. При этом в финансовых документах при указании сумм слово одна опускать не принято.
Как название торговой марки – "Бакарди". Как название алкогольного напитка – бакарди.
Верно: было не одна и не две.
Оба варианта возможны, выбирайте подходящий по смыслу.
Правильно: одна тысяча девятьсот девяносто восемь рублей. Девяноста – форма косвенных падежей: (нет) девяноста рублей.
Использовать это слово нет необходимости.
Этот выражение может выступать как фразеологизованный (цельный) оборот.