Напухнуть – просторечное слово, опухнуть – общеупотребительное и стилистически нейтральное. Грамотно: щека опухла.
Сочетания типа двое бровей, двое щек созданы с нарушением нормы, однако вполне возможно употребление слов бровь и щека с собирательным числительным оба (см. данные нормативных словарей).
Подробнее о сочетаемости собирательных числительных см. в пособии Е. И. Литневской и в «Русской грамматике» (§ 1369).
Можно воспользоваться «Словарем собственных имен русского языка» Ф. Л. Агеенко (М., 2010) или его электронной версией на нашем портале: красным цветом выделено ударение.
Корректно: (целовать) в обе щеки, уписывать за обе щеки (есть с большим аппетитом).
Правильно: за щекАми.