Верен первый вариант.
Выбор окончания зависит от того, кто готовит кадры нефтегазовой отрасли: только определенный профессорско-преподавательский состав или учебные заведения в целом.
Верно: учебный план МОУ "Орлинская СОШ".
Предпочтителен второй вариант.
Корректно: заведующий учебной частью.
Слова ученый совет пишутся строчными.
Возможный вариант: Учебный план профессиональной подготовки.