Если местоимения вы, ваш употребляются при разговоре, то есть при передаче устной речи персонажей, то они пишутся со строчной буквы, даже если обращены к одному лицу. Нет оснований считать приведенное сочетание исключением.
Пунктуация верна.
Предложение лучше несколько перестроить: Материалы, подобранные неправильно, без учета их экологических характеристик, могут стать источниками выделения вредных химических соединений в воздух помещений, в том числе фенола, формальдегида, аммиака.