Словари фиксируют написание этих слов без кавычек: вольный каменщик, вольные каменщики.
В сочетании Великий магистр (в знач. 'глава ордена') первое слово пишется с большой буквы.
Во всех доступных нам словарях у слова масонский зафиксировано только одно значение - "относящийся к масонам, масонству". Никаких переносных значений у этого слова не отмечено. Вероятно, в приведенном Вами примере прилагательное масонский употреблено в прямом значении: знак, принятый среди масонов.