Правильно: червонною листвой; заворожит.

В обоих случаях запятые перед как нужны.

Запятая нужна.

Нет необходимости заключать это сочетание в кавычки.

Дополнительные запятые не требуются.

Предпочтительно: интегрировано в систему.

Лучше: Неэффективные и отключенные из-за низкого CTR фразы уточняются системой.

Здесь действует следующее правило.

При двух или нескольких управляющих словах общее зависимое слово допустимо тогда, когда каждое из управляющих слов требует того же падежа и предлога, например: читать и конспектировать книгу; подбирать и готовить кадры.

Наличие общего зависимого слова при различном управлении нарушает стилистическую норму, например: «с помощью и в сотрудничестве с местными организациями» (ср. правильный вариант: с помощью местных организаций и в сотрудничестве с ними).

Поэтому в Вашем случае верно: управление системой и контроль над ней. О предлогах при слове контроль см. в вопросе 277510.

Нужна только точка в конце предложения.