Запятые не требуются, в остальном пунктуация верна.
В словах, образованных от основ, оканчивающихся на две одинаковые согласные, двойные согласные перед суффиксом сохраняются (кроме исключений вроде слова кристальный). Поэтому верно написание: капелльный.
Верно: Однажды Капелла после прочтения энциклопедии о грызунах начала выпрашивать у родителей...
Нет, следует писать без кавычек.